Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLRF1Q9NZS2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms