Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RDH8Q9NYR8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RDH8Q9NYR8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RDH8Q9NYR8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RDH8Q9NYR8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RDH8Q9NYR8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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