Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TBCCD1Q9NVR7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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