Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms