Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHST12Q9NRB3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms