Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MID1IP1Q9NPA3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms