Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms