Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM15Q9C019 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms