Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LPIN3Q9BQK8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms