Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3GL3Q99963 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3GL3Q99963 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms