Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms