Protein–RNA interactions for Protein: Q99705

MCHR1, Melanin-concentrating hormone receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCHR1Q99705 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCHR1Q99705 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms