Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
YTHDC1Q96MU7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YTHDC1Q96MU7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms