Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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