Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DNAJA4Q8WW22 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms