Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYRIPQ8NFW9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms