Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT28Q7Z3Y7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT28Q7Z3Y7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms