Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC141Q6ZP82 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC141Q6ZP82 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms