Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCBE1Q6UXH8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCBE1Q6UXH8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCBE1Q6UXH8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCBE1Q6UXH8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCBE1Q6UXH8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCBE1Q6UXH8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCBE1Q6UXH8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCBE1Q6UXH8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCBE1Q6UXH8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCBE1Q6UXH8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCBE1Q6UXH8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCBE1Q6UXH8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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