Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms