Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATL3Q6DD88 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATL3Q6DD88 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms