Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HES3Q5TGS1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HES3Q5TGS1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HES3Q5TGS1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms