Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms