Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPAT3Q53EU6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms