Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00303Q3SY05 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00303Q3SY05 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms