Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBPF1Q3BBV0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms