Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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