Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDO1Q16878 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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