Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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