Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SMCO1Q147U7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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