Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSPNQ14714 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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