Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PKP1Q13835 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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