Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3CQ13748 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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TUBA3CQ13748 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TUBA3CQ13748 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBA3CQ13748 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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