Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA1SQ13698 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA1SQ13698 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms