Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PEX6Q13608 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PEX6Q13608 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PEX6Q13608 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PEX6Q13608 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PEX6Q13608 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PEX6Q13608 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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