Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BFSP2Q13515 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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