Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P3Q13401 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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