Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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TRAF1Q13077 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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