Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NFIAQ12857 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms