Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNB2Q08289 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms