Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms