Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABPAQ06546 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms