Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms