Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB3Q05901 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms