Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTUD4Q01804 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms