Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRF9Q00978 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRF9Q00978 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms