Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HPCAP84074 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HPCAP84074 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms