Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IRX1P78414 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms