Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAE1P78406 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAE1P78406 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAE1P78406 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms