Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms